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Localization Properties of Electronic States in Polaron Model of poly(dG)-poly(dC) and poly(dA)-poly(dT) DNA polymers

机译:聚(dG)-聚(dC)和聚(dA)-聚(dT)DNA聚合物的极化子模型中电子态的定位特性

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摘要

We numerically investigate localization properties of electronic states in a static model ofpoly(dG)-poly(dC) and poly(dA)-poly(dT) DNA polymers with realistic parameters obtained byquantum-chemical calculation. The randomness in the on-site energies caused by the electronphononcoupling are completely correlated to the off-diagonal parts. In the single electron model,the effect of the hydrogen-bond stretchings, the twist angles between the base pairs and the finitesystem size effects on the energy dependence of the localization length and on the Lyapunov exponentare given. The localization length is reduced by the influence of the fluctuations in the hydrogenbond stretchings. It is also shown that the helical twist angle affects the localization length in thepoly(dG)-poly(dC) DNA polymer more strongly than in the poly(dA)-poly(dT) one. Furthermore,we show resonance structures in the energy dependence of the localization length when the systemsize is relatively small.
机译:我们用静态化学方法通过量子化学计算获得的聚(dG)-聚(dC)和聚(dA)-聚(dT)DNA聚合物的静态模型中数值研究电子态的定位特性。由电子声子耦合引起的现场能量的随机性与非对角线部分完全相关。在单电子模型中,给出了氢键拉伸,碱基对之间的扭转角和有限系统尺寸对定位长度的能量依赖性和Lyapunov指数的影响。通过氢键拉伸中的波动的影响减小了定位长度。还表明,螺旋扭转角对聚(dG)-聚(dC)DNA聚合物的定位长度的影响比聚(dA)-聚(dT)聚合物中的定位长度更强烈。此外,当系统尺寸相对较小时,我们在局部长度的能量依赖性中显示出共振结构。

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